Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CRB2Q5IJ48 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRB2Q5IJ48 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB2Q5IJ48 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms