Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALFQ53S48 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALFQ53S48 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ALFQ53S48 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms