Protein–RNA interactions for Protein: Q53FP2

TMEM35A, Transmembrane protein 35A, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35AQ53FP2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM35AQ53FP2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM35AQ53FP2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM35AQ53FP2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM35AQ53FP2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM35AQ53FP2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM35AQ53FP2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM35AQ53FP2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM35AQ53FP2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM35AQ53FP2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM35AQ53FP2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM35AQ53FP2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35AQ53FP2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35AQ53FP2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35AQ53FP2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35AQ53FP2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35AQ53FP2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35AQ53FP2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35AQ53FP2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35AQ53FP2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35AQ53FP2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35AQ53FP2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35AQ53FP2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35AQ53FP2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM35AQ53FP2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms