Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GREB1Q4ZG55 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GREB1Q4ZG55 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms