Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC01620Q4KN68 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01620Q4KN68 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms