Protein–RNA interactions for Protein: Q4JDL3

PTPN20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN20Q4JDL3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN20Q4JDL3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN20Q4JDL3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPN20Q4JDL3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN20Q4JDL3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN20Q4JDL3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN20Q4JDL3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN20Q4JDL3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN20Q4JDL3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN20Q4JDL3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN20Q4JDL3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN20Q4JDL3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN20Q4JDL3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN20Q4JDL3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN20Q4JDL3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN20Q4JDL3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN20Q4JDL3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN20Q4JDL3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN20Q4JDL3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN20Q4JDL3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN20Q4JDL3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms