Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0Z9

MCMDC2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMDC2Q4G0Z9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCMDC2Q4G0Z9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCMDC2Q4G0Z9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
MCMDC2Q4G0Z9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCMDC2Q4G0Z9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCMDC2Q4G0Z9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCMDC2Q4G0Z9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCMDC2Q4G0Z9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCMDC2Q4G0Z9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCMDC2Q4G0Z9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCMDC2Q4G0Z9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCMDC2Q4G0Z9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCMDC2Q4G0Z9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCMDC2Q4G0Z9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCMDC2Q4G0Z9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MCMDC2Q4G0Z9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCMDC2Q4G0Z9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCMDC2Q4G0Z9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCMDC2Q4G0Z9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms