Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DUSP28Q4G0W2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
DUSP28Q4G0W2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUSP28Q4G0W2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms