Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP221Q4G0U5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CFAP221Q4G0U5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP221Q4G0U5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms