Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBC4

PRICKLE4, Prickle-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE4Q2TBC4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRICKLE4Q2TBC4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms