Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIP11Q15643 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIP11Q15643 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIP11Q15643 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIP11Q15643 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
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