Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF1Q15637 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF1Q15637 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF1Q15637 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF1Q15637 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF1Q15637 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF1Q15637 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF1Q15637 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF1Q15637 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF1Q15637 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF1Q15637 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF1Q15637 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF1Q15637 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF1Q15637 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF1Q15637 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF1Q15637 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF1Q15637 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF1Q15637 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF1Q15637 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF1Q15637 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF1Q15637 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF1Q15637 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF1Q15637 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF1Q15637 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF1Q15637 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SF1Q15637 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF1Q15637 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF1Q15637 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF1Q15637 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF1Q15637 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SF1Q15637 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF1Q15637 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF1Q15637 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF1Q15637 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF1Q15637 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF1Q15637 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF1Q15637 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF1Q15637 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF1Q15637 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF1Q15637 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF1Q15637 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF1Q15637 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SF1Q15637 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF1Q15637 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF1Q15637 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF1Q15637 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF1Q15637 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SF1Q15637 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF1Q15637 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF1Q15637 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF1Q15637 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF1Q15637 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF1Q15637 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF1Q15637 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF1Q15637 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF1Q15637 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF1Q15637 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF1Q15637 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF1Q15637 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF1Q15637 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF1Q15637 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF1Q15637 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF1Q15637 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF1Q15637 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF1Q15637 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF1Q15637 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF1Q15637 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF1Q15637 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF1Q15637 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF1Q15637 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF1Q15637 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF1Q15637 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF1Q15637 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF1Q15637 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SF1Q15637 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF1Q15637 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF1Q15637 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF1Q15637 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF1Q15637 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF1Q15637 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF1Q15637 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF1Q15637 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF1Q15637 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF1Q15637 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF1Q15637 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF1Q15637 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SF1Q15637 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF1Q15637 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF1Q15637 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF1Q15637 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF1Q15637 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SF1Q15637 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SF1Q15637 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SF1Q15637 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SF1Q15637 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SF1Q15637 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SF1Q15637 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SF1Q15637 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SF1Q15637 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SF1Q15637 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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