Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAM1Q15629 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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TRAM1Q15629 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAM1Q15629 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAM1Q15629 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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