Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEA2Q15560 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCEA2Q15560 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCEA2Q15560 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
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