Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEC23BQ15437 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC23BQ15437 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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