Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
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SEC23AQ15436 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
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SEC23AQ15436 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
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SEC23AQ15436 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
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SEC23AQ15436 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEC23AQ15436 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
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SEC23AQ15436 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
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SEC23AQ15436 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEC23AQ15436 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEC23AQ15436 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEC23AQ15436 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEC23AQ15436 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEC23AQ15436 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEC23AQ15436 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC23AQ15436 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC23AQ15436 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC23AQ15436 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC23AQ15436 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC23AQ15436 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC23AQ15436 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC23AQ15436 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC23AQ15436 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
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