Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAM2Q15035 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAM2Q15035 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAM2Q15035 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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