Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GBX1Q14549 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBX1Q14549 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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