Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPIDRQ14159 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIDRQ14159 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms