Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL9A3Q14050 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL9A3Q14050 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL9A3Q14050 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
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