Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL4A6Q14031 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A6Q14031 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A6Q14031 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms