Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CNGB1Q14028 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CNGB1Q14028 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
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CNGB1Q14028 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CNGB1Q14028 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
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