Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBFBQ13951 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBFBQ13951 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBFBQ13951 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBFBQ13951 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBFBQ13951 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBFBQ13951 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBFBQ13951 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBFBQ13951 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFBQ13951 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFBQ13951 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFBQ13951 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFBQ13951 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFBQ13951 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFBQ13951 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFBQ13951 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFBQ13951 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBFBQ13951 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBFBQ13951 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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