Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBA3CQ13748 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBA3CQ13748 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
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