Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ALCAMQ13740 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALCAMQ13740 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALCAMQ13740 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
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