Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CUL4BQ13620 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CUL4BQ13620 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CUL4BQ13620 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
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