Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRPF4BQ13523 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF4BQ13523 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
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