Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSAMPQ13449 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LSAMPQ13449 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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