Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED1Q13445 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED1Q13445 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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