Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PMS2P3Q13401 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMS2P3Q13401 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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