Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
STRN3Q13033 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
STRN3Q13033 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRN3Q13033 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
STRN3Q13033 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
STRN3Q13033 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRN3Q13033 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRN3Q13033 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms