Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK3Q13003 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GRIK3Q13003 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK3Q13003 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
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