Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAF2Q12933 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF2Q12933 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF2Q12933 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
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