Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRJQ12913 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRJQ12913 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRJQ12913 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
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