Protein–RNA interactions for Protein: Q12815

TROAP, Tastin, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAPQ12815 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TROAPQ12815 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TROAPQ12815 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TROAPQ12815 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TROAPQ12815 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TROAPQ12815 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TROAPQ12815 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TROAPQ12815 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TROAPQ12815 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TROAPQ12815 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TROAPQ12815 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TROAPQ12815 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TROAPQ12815 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TROAPQ12815 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TROAPQ12815 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TROAPQ12815 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TROAPQ12815 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TROAPQ12815 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TROAPQ12815 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TROAPQ12815 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TROAPQ12815 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TROAPQ12815 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TROAPQ12815 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TROAPQ12815 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TROAPQ12815 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TROAPQ12815 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TROAPQ12815 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TROAPQ12815 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TROAPQ12815 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TROAPQ12815 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TROAPQ12815 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TROAPQ12815 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TROAPQ12815 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TROAPQ12815 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TROAPQ12815 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TROAPQ12815 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TROAPQ12815 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TROAPQ12815 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TROAPQ12815 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TROAPQ12815 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TROAPQ12815 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TROAPQ12815 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TROAPQ12815 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TROAPQ12815 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TROAPQ12815 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TROAPQ12815 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TROAPQ12815 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TROAPQ12815 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms