Protein–RNA interactions for Protein: Q12420

SNU66, 66 kDa U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein component, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNU66Q12420 SCO2YBR024W 906 nt6.74□□□□□ -1.33
SNU66Q12420 MKC7YDR144C 1791 nt6.74□□□□□ -1.33
SNU66Q12420 GLN3YER040W 2193 nt6.74□□□□□ -1.33
SNU66Q12420 PKC1YBL105C 3456 nt6.73□□□□□ -1.33
SNU66Q12420 SKI2YLR398C 3864 nt6.73□□□□□ -1.33
SNU66Q12420 EIS1YMR031C 2532 nt6.73□□□□□ -1.33
SNU66Q12420 GON7YJL184W 372 nt6.73□□□□□ -1.33
SNU66Q12420 EFM3YJR129C 1020 nt6.73□□□□□ -1.33
SNU66Q12420 ICT1YLR099C 1185 nt6.73□□□□□ -1.33
SNU66Q12420 YLR194CYLR194C 765 nt6.73□□□□□ -1.33
SNU66Q12420 NOP2YNL061W 1857 nt6.73□□□□□ -1.33
SNU66Q12420 HSP78YDR258C 2436 nt6.72□□□□□ -1.33
SNU66Q12420 HXT2YMR011W 1626 nt6.72□□□□□ -1.33
SNU66Q12420 GEX1YCL073C 1848 nt6.72□□□□□ -1.33
SNU66Q12420 FPR2YDR519W 408 nt6.72□□□□□ -1.33
SNU66Q12420 MLC1YGL106W 450 nt6.72□□□□□ -1.33
SNU66Q12420 MLC2YPR188C 492 nt6.72□□□□□ -1.33
SNU66Q12420 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt6.72□□□□□ -1.33
SNU66Q12420 VNX1YNL321W 2727 nt6.72□□□□□ -1.33
SNU66Q12420 GAT1YFL021W 1533 nt6.71□□□□□ -1.33
SNU66Q12420 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt6.71□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 YFL064CYFL064C 525 nt6.71□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 HSX1tR(CCU)J 72 nt6.71□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 PGU1YJR153W 1086 nt6.71□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 PIN2YOR104W 849 nt6.71□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 YPR202WYPR202W 717 nt6.71□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 DPB2YPR175W 2070 nt6.71□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 YAP1801YHR161C 1914 nt6.71□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 ECM7YLR443W 1347 nt6.71□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 TEL2YGR099W 2067 nt6.7□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 COX26YDR119W-A 201 nt6.7□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 HCR1YLR192C 798 nt6.7□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 TAL1YLR354C 1008 nt6.7□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 CAR1YPL111W 1002 nt6.7□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 PDB1YBR221C 1101 nt6.7□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 POP1YNL221C 2628 nt6.7□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 AVT4YNL101W 2142 nt6.7□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 CYC8YBR112C 2901 nt6.7□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 COX17YLL009C 210 nt6.69□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 SUB2YDL084W 1341 nt6.69□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 GUP2YPL189W 1830 nt6.69□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 TEA1YOR337W 2280 nt6.68□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 KNH1YDL049C 807 nt6.68□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 MRPL13YKR006C 795 nt6.68□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 TFS1YLR178C 660 nt6.68□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 RTT106YNL206C 1368 nt6.68□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 FAT3YKL187C 2253 nt6.67□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 YJU2YKL095W 837 nt6.67□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 YLR118CYLR118C 684 nt6.67□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 NUD1YOR373W 2556 nt6.67□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 ISC1YER019W 1434 nt6.67□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 YEL020CYEL020C 1683 nt6.66□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 YJR115WYJR115W 510 nt6.66□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 DOM34YNL001W 1161 nt6.66□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 VMA4YOR332W 702 nt6.66□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 SNZ3YFL059W 897 nt6.65□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt6.65□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt6.65□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt6.65□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt6.65□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt6.65□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt6.65□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt6.65□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt6.65□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt6.65□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt6.65□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 YGR127WYGR127W 939 nt6.65□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 VMA16YHR026W 642 nt6.65□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 SNZ2YNL333W 897 nt6.65□□□□□ -1.34
SNU66Q12420 VPS4YPR173C 1314 nt6.65□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 TIM54YJL054W 1437 nt6.65□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 PYC1YGL062W 3537 nt6.64□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 CAD1YDR423C 1230 nt6.64□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 ARP1YHR129C 1155 nt6.64□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 YIL077CYIL077C 963 nt6.64□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 PGA3YML125C 939 nt6.64□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 BUL1YMR275C 2931 nt6.64□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 RSA4YCR072C 1548 nt6.64□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 IMA5YJL216C 1746 nt6.64□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 NOP7YGR103W 1818 nt6.64□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 YDL057WYDL057W 987 nt6.63□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 COX9YDL067C 180 nt6.63□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 THI4YGR144W 981 nt6.63□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 SMF2YHR050W 1650 nt6.63□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 COS9YKL219W 1224 nt6.63□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt6.63□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 ADE13YLR359W 1449 nt6.62□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 YDL034WYDL034W 345 nt6.62□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 GAT4YIR013C 366 nt6.62□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 CIS3YJL158C 684 nt6.62□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 YKL151CYKL151C 1014 nt6.62□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 YML131WYML131W 1098 nt6.62□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 PEX32YBR168W 1242 nt6.62□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 CCZ1YBR131W 2115 nt6.61□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 TRK2YKR050W 2670 nt6.61□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 YGR182CYGR182C 354 nt6.61□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 YLL059CYLL059C 507 nt6.61□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 EFT2YDR385W 2529 nt6.61□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 EFT1YOR133W 2529 nt6.61□□□□□ -1.35
SNU66Q12420 SHE10YGL228W 1734 nt6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.5 ms