Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RASGEF1BQ0VAM2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms