Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYCNQ0VAF6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYCNQ0VAF6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.5 ms