Protein–RNA interactions for Protein: Q08AN1

ZNF616, Zinc finger protein 616, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF616Q08AN1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ZNF616Q08AN1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF616Q08AN1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms