Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPIRE1Q08AE8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SPIRE1Q08AE8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms