Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4DQ08499 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4DQ08499 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms