Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFF3Q07654 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TFF3Q07654 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFF3Q07654 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.7 ms