Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBQ06643 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBQ06643 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBQ06643 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBQ06643 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBQ06643 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBQ06643 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBQ06643 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBQ06643 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBQ06643 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBQ06643 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBQ06643 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBQ06643 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBQ06643 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBQ06643 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBQ06643 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBQ06643 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBQ06643 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBQ06643 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBQ06643 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBQ06643 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBQ06643 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBQ06643 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBQ06643 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBQ06643 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBQ06643 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBQ06643 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBQ06643 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LTBQ06643 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LTBQ06643 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LTBQ06643 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBQ06643 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBQ06643 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBQ06643 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBQ06643 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBQ06643 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBQ06643 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBQ06643 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBQ06643 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBQ06643 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBQ06643 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBQ06643 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBQ06643 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBQ06643 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBQ06643 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBQ06643 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBQ06643 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBQ06643 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTBQ06643 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBQ06643 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBQ06643 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBQ06643 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBQ06643 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBQ06643 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBQ06643 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBQ06643 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBQ06643 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBQ06643 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBQ06643 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBQ06643 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBQ06643 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBQ06643 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBQ06643 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LTBQ06643 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBQ06643 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBQ06643 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBQ06643 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBQ06643 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBQ06643 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBQ06643 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBQ06643 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTBQ06643 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBQ06643 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBQ06643 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBQ06643 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBQ06643 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBQ06643 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBQ06643 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBQ06643 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBQ06643 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBQ06643 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBQ06643 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBQ06643 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LTBQ06643 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTBQ06643 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTBQ06643 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTBQ06643 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LTBQ06643 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTBQ06643 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LTBQ06643 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LTBQ06643 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LTBQ06643 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTBQ06643 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LTBQ06643 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LTBQ06643 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTBQ06643 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTBQ06643 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTBQ06643 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTBQ06643 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LTBQ06643 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms