Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 RPS15YOL040C 429 nt5.21□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 UBC11YOR339C 471 nt5.21□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 RGT1YKL038W 3513 nt5.21□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 UBX2YML013W 1755 nt5.21□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 SNT2YGL131C 4212 nt5.21□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 SRP101YDR292C 1866 nt5.2□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 MSP1YGR028W 1089 nt5.2□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 NQM1YGR043C 1002 nt5.2□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 YGR176WYGR176W 348 nt5.2□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 APS3YJL024C 585 nt5.2□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 TDH2YJR009C 999 nt5.2□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 RPS5YJR123W 678 nt5.2□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 MRPL10YNL284C 969 nt5.2□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 OXP1YKL215C 3861 nt5.2□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 GLE1YDL207W 1617 nt5.19□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 BUD9YGR041W 1644 nt5.19□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 DDC1YPL194W 1839 nt5.19□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 MDH3YDL078C 1032 nt5.19□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 TRP1YDR007W 675 nt5.19□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 OPI7YDR360W 435 nt5.19□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.19□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 YPL136WYPL136W 369 nt5.19□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 HXT3YDR345C 1704 nt5.18□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 SMF3YLR034C 1422 nt5.18□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt5.18□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 RHO3YIL118W 696 nt5.18□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 DRE2YKR071C 1047 nt5.18□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.18□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 YBL112CYBL112C 318 nt5.18□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 YBR144CYBR144C 315 nt5.18□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 HFI1YPL254W 1467 nt5.18□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 CMR1YDL156W 1569 nt5.17□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 PRI2YKL045W 1587 nt5.17□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 CCZ1YBR131W 2115 nt5.17□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 MRF1YGL143C 1242 nt5.17□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 VAM7YGL212W 951 nt5.17□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 YML101C-AYML101C-A 318 nt5.17□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 YBL044WYBL044W 369 nt5.17□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 MRPS5YBR251W 924 nt5.17□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 VMS1YDR049W 1899 nt5.17□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 FOL1YNL256W 2475 nt5.17□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 CHS5YLR330W 2016 nt5.16□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 NOP2YNL061W 1857 nt5.16□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 MTQ1YNL063W 945 nt5.16□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 CSG2YBR036C 1233 nt5.16□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 TFB4YPR056W 1017 nt5.16□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 BUL1YMR275C 2931 nt5.16□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 PIF1YML061C 2580 nt5.15□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 CIT3YPR001W 1461 nt5.15□□□□□ -1.58
NEJ1Q06148 RPS9AYPL081W 594 nt5.15□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 SSY5YJL156C 2100 nt5.15□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 MAL11YGR289C 1851 nt5.15□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 SPS22YCL048W 1392 nt5.15□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 ATE1YGL017W 1512 nt5.14□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 UBA1YKL210W 3075 nt5.14□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 MTQ2YDR140W 666 nt5.14□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 YHL018WYHL018W 363 nt5.14□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 APN1YKL114C 1104 nt5.14□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 SPG4YMR107W 348 nt5.14□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 VHS1YDR247W 1386 nt5.14□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 TEF1YPR080W 1377 nt5.14□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 TEF2YBR118W 1377 nt5.14□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 PMP3YDR276C 168 nt5.13□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 RML2YEL050C 1182 nt5.13□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 MDH1YKL085W 1005 nt5.13□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 COX17YLL009C 210 nt5.13□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 RNH201YNL072W 924 nt5.13□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 MET8YBR213W 825 nt5.13□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 SNU71YGR013W 1863 nt5.13□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 SIP5YMR140W 1470 nt5.13□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 FRE3YOR381W 2136 nt5.12□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 TAX4YJL083W 1815 nt5.12□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 RAD53YPL153C 2466 nt5.12□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 YDL114WYDL114W 927 nt5.12□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 MTW1YAL034W-A 870 nt5.12□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 NME1NME1 340 nt5.12□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 VAN1YML115C 1608 nt5.12□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 BUD14YAR014C 2130 nt5.11□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 GCV3YAL044C 513 nt5.11□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 QRI5YLR204W 336 nt5.11□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 ENV9YOR246C 993 nt5.11□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 snR32snR32 188 nt5.11□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 PRP46YPL151C 1356 nt5.11□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 DSF1YEL070W 1509 nt5.11□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 YNR073CYNR073C 1509 nt5.11□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 UTP9YHR196W 1728 nt5.11□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 RRP9YPR137W 1722 nt5.11□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 GCS1YDL226C 1059 nt5.1□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 FOB1YDR110W 1701 nt5.1□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 UTP7YER082C 1665 nt5.1□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 RRP46YGR095C 672 nt5.1□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 BRF1YGR246C 1791 nt5.1□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 VMA16YHR026W 642 nt5.1□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 PHO86YJL117W 936 nt5.1□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 ADE12YNL220W 1302 nt5.1□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 NRM1YNR009W 750 nt5.1□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 RAT1YOR048C 3021 nt5.1□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 HES1YOR237W 1305 nt5.1□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt5.1□□□□□ -1.59
NEJ1Q06148 RIM15YFL033C 5313 nt5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.5 ms