Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRKCDQ05655 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCDQ05655 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCDQ05655 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms