Protein–RNA interactions for Protein: Q02630

NUP116, Nucleoporin NUP116/NSP116, yeastyeast

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP116Q02630 COX20YDR231C 618 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 SIP2YGL208W 1248 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 HAP2YGL237C 798 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 YHL018WYHL018W 363 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 YHR145CYHR145C 357 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 YLR296WYLR296W 327 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 PDB1YBR221C 1101 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 VPS72YDR485C 2388 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 HIR1YBL008W 2523 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 CCZ1YBR131W 2115 nt5.36□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 VAM7YGL212W 951 nt5.36□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 YDL129WYDL129W 876 nt5.35□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 YDR401WYDR401W 564 nt5.35□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 CWC21YDR482C 408 nt5.35□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 HAP3YBL021C 435 nt5.35□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 HSF1YGL073W 2502 nt5.35□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 YPK2YMR104C 2034 nt5.35□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 ECM3YOR092W 1842 nt5.34□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 FOB1YDR110W 1701 nt5.34□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 ERC1YHR032W 1746 nt5.34□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 YDL057WYDL057W 987 nt5.34□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt5.34□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 ENT2YLR206W 1842 nt5.34□□□□□ -1.55
NUP116Q02630 ARO10YDR380W 1908 nt5.33□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 ACC1YNR016C 6702 nt5.33□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 RPS2YGL123W 765 nt5.33□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 YLR317WYLR317W 435 nt5.33□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 JNM1YMR294W 1122 nt5.33□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 YIR007WYIR007W 2295 nt5.33□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 DRS1YLL008W 2259 nt5.33□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 ATG4YNL223W 1485 nt5.32□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.32□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 HOS1YPR068C 1413 nt5.32□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 RBA50YDR527W 1320 nt5.32□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 VCX1YDL128W 1236 nt5.32□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 RME1YGR044C 903 nt5.32□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 MID1YNL291C 1647 nt5.32□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 RAD24YER173W 1980 nt5.31□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 SCT1YBL011W 2280 nt5.31□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 LEU5YHR002W 1074 nt5.31□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 RPS5YJR123W 678 nt5.31□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 MTC2YKL098W 1074 nt5.31□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 ENP1YBR247C 1452 nt5.31□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 DIA3YDL024C 1407 nt5.31□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 IES1YFL013C 2079 nt5.3□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 YGR176WYGR176W 348 nt5.3□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 ARP1YHR129C 1155 nt5.3□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.3□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 PYC1YGL062W 3537 nt5.3□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 UTP4YDR324C 2331 nt5.3□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 YKR073CYKR073C 321 nt5.29□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 RHO2YNL090W 579 nt5.29□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 VAN1YML115C 1608 nt5.29□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 ASH1YKL185W 1767 nt5.29□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 ATG23YLR431C 1362 nt5.29□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 CLP1YOR250C 1338 nt5.28□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 SMF2YHR050W 1650 nt5.28□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 SIT4YDL047W 936 nt5.28□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.28□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.28□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.28□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 SFC1YJR095W 969 nt5.28□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 GCV3YAL044C 513 nt5.28□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 SLD7YOR060C 774 nt5.28□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt5.28□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 RRT2YBR246W 1164 nt5.28□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 DBP9YLR276C 1785 nt5.28□□□□□ -1.56
NUP116Q02630 RSC30YHR056C 2652 nt5.27□□□□□ -1.57
NUP116Q02630 VTC2YFL004W 2487 nt5.27□□□□□ -1.57
NUP116Q02630 DOM34YNL001W 1161 nt5.27□□□□□ -1.57
NUP116Q02630 PPR1YLR014C 2715 nt5.27□□□□□ -1.57
NUP116Q02630 SKS1YPL026C 1509 nt5.27□□□□□ -1.57
NUP116Q02630 PRI2YKL045W 1587 nt5.26□□□□□ -1.57
NUP116Q02630 DOT5YIL010W 648 nt5.26□□□□□ -1.57
NUP116Q02630 REV7YIL139C 738 nt5.26□□□□□ -1.57
NUP116Q02630 HOR7YMR251W-A 180 nt5.26□□□□□ -1.57
NUP116Q02630 VNX1YNL321W 2727 nt5.26□□□□□ -1.57
NUP116Q02630 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.26□□□□□ -1.57
NUP116Q02630 MNN2YBR015C 1794 nt5.25□□□□□ -1.57
NUP116Q02630 HEM3YDL205C 984 nt5.25□□□□□ -1.57
NUP116Q02630 BUD32YGR262C 786 nt5.25□□□□□ -1.57
NUP116Q02630 RHO3YIL118W 696 nt5.25□□□□□ -1.57
NUP116Q02630 GAT4YIR013C 366 nt5.25□□□□□ -1.57
NUP116Q02630 PSH1YOL054W 1221 nt5.25□□□□□ -1.57
NUP116Q02630 ODC2YOR222W 924 nt5.25□□□□□ -1.57
NUP116Q02630 ENV9YOR246C 993 nt5.25□□□□□ -1.57
NUP116Q02630 ERI1YPL096C-A 207 nt5.25□□□□□ -1.57
NUP116Q02630 RFA1YAR007C 1866 nt5.25□□□□□ -1.57
NUP116Q02630 HPF1YOL155C 2904 nt5.24□□□□□ -1.57
NUP116Q02630 MKC7YDR144C 1791 nt5.24□□□□□ -1.57
NUP116Q02630 QDR3YBR043C 2070 nt5.24□□□□□ -1.57
NUP116Q02630 NSI1YDR026C 1713 nt5.24□□□□□ -1.57
NUP116Q02630 KSS1YGR040W 1107 nt5.24□□□□□ -1.57
NUP116Q02630 PHB1YGR132C 864 nt5.24□□□□□ -1.57
NUP116Q02630 STM1YLR150W 822 nt5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.2 ms