Protein–RNA interactions for Protein: Q02199

NUP49, Nucleoporin NUP49/NSP49, yeastyeast

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP49Q02199 YDR396WYDR396W 501 nt5.25□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 YER010CYER010C 705 nt5.25□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.25□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 PGA2YNL149C 390 nt5.25□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 CPA1YOR303W 1236 nt5.25□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 SIA1YOR137C 1869 nt5.25□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 ALT1YLR089C 1779 nt5.24□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 RNR3YIL066C 2610 nt5.24□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 GCV3YAL044C 513 nt5.24□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 ASF2YDL197C 1578 nt5.24□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 OPT1YJL212C 2400 nt5.24□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 STL1YDR536W 1710 nt5.23□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 UTP9YHR196W 1728 nt5.23□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 YAP1801YHR161C 1914 nt5.23□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 COX20YDR231C 618 nt5.23□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 POR2YIL114C 846 nt5.23□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 YJL193WYJL193W 1209 nt5.23□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 UBC11YOR339C 471 nt5.23□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 RGT1YKL038W 3513 nt5.23□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 YME1YPR024W 2244 nt5.23□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 RPT4YOR259C 1314 nt5.23□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 PIF1YML061C 2580 nt5.22□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 BUD32YGR262C 786 nt5.22□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 HCR1YLR192C 798 nt5.22□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 CIN4YMR138W 576 nt5.22□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 BAP2YBR068C 1830 nt5.22□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 ERG7YHR072W 2196 nt5.22□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 TAH18YPR048W 1872 nt5.22□□□□□ -1.57
NUP49Q02199 APS3YJL024C 585 nt5.21□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 MPM1YJL066C 759 nt5.21□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt5.21□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 SNU71YGR013W 1863 nt5.21□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 SKS1YPL026C 1509 nt5.21□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 HFI1YPL254W 1467 nt5.2□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 UBA1YKL210W 3075 nt5.2□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 ROG3YFR022W 2202 nt5.2□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 CST6YIL036W 1764 nt5.2□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 MOG1YJR074W 657 nt5.2□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 COX17YLL009C 210 nt5.2□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 YBR144CYBR144C 315 nt5.2□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 PRI2YKL045W 1587 nt5.2□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 RPT2YDL007W 1314 nt5.2□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 ADE12YNL220W 1302 nt5.2□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 EIS1YMR031C 2532 nt5.2□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 RAT1YOR048C 3021 nt5.19□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt5.19□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 ZRT2YLR130C 1269 nt5.19□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 RPO26YPR187W 468 nt5.19□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 FLC3YGL139W 2409 nt5.19□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 HXT3YDR345C 1704 nt5.19□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 GLE1YDL207W 1617 nt5.19□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 GLO2YDR272W 825 nt5.18□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 YBL044WYBL044W 369 nt5.18□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 MTQ1YNL063W 945 nt5.18□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 RPS9AYPL081W 594 nt5.18□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 MRPS5YBR251W 924 nt5.18□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 BUL1YMR275C 2931 nt5.18□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 ISN1YOR155C 1353 nt5.17□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 UTP18YJL069C 1785 nt5.17□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 UBX2YML013W 1755 nt5.17□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 YMR027WYMR027W 1413 nt5.17□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 SSZ1YHR064C 1617 nt5.17□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 MAK32YCR019W 1092 nt5.17□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 CDC43YGL155W 1131 nt5.17□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 APN1YKL114C 1104 nt5.17□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 RPS15YOL040C 429 nt5.17□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 DEF1YKL054C 2217 nt5.17□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 SIT1YEL065W 1887 nt5.17□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 NRD1YNL251C 1728 nt5.17□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 YMR155WYMR155W 1644 nt5.16□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 PRE3YJL001W 648 nt5.16□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 CSG2YBR036C 1233 nt5.16□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 HST2YPL015C 1074 nt5.16□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 SSY5YJL156C 2100 nt5.15□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 VBA1YMR088C 1689 nt5.15□□□□□ -1.58
NUP49Q02199 VAM7YGL212W 951 nt5.15□□□□□ -1.59
NUP49Q02199 NQM1YGR043C 1002 nt5.15□□□□□ -1.59
NUP49Q02199 PRS1YKL181W 1284 nt5.15□□□□□ -1.59
NUP49Q02199 LYS21YDL131W 1323 nt5.15□□□□□ -1.59
NUP49Q02199 AVO1YOL078W 3531 nt5.15□□□□□ -1.59
NUP49Q02199 NCS6YGL211W 1080 nt5.14□□□□□ -1.59
NUP49Q02199 YKR041WYKR041W 753 nt5.14□□□□□ -1.59
NUP49Q02199 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.14□□□□□ -1.59
NUP49Q02199 SPG4YMR107W 348 nt5.14□□□□□ -1.59
NUP49Q02199 SEC17YBL050W 879 nt5.14□□□□□ -1.59
NUP49Q02199 PDB1YBR221C 1101 nt5.14□□□□□ -1.59
NUP49Q02199 SEC18YBR080C 2277 nt5.14□□□□□ -1.59
NUP49Q02199 CCZ1YBR131W 2115 nt5.14□□□□□ -1.59
NUP49Q02199 OXP1YKL215C 3861 nt5.13□□□□□ -1.59
NUP49Q02199 MNS1YJR131W 1650 nt5.13□□□□□ -1.59
NUP49Q02199 MED6YHR058C 888 nt5.13□□□□□ -1.59
NUP49Q02199 PRP46YPL151C 1356 nt5.13□□□□□ -1.59
NUP49Q02199 ACF2YLR144C 2340 nt5.13□□□□□ -1.59
NUP49Q02199 SMF3YLR034C 1422 nt5.13□□□□□ -1.59
NUP49Q02199 MAL11YGR289C 1851 nt5.12□□□□□ -1.59
NUP49Q02199 YDL114WYDL114W 927 nt5.12□□□□□ -1.59
NUP49Q02199 VHS1YDR247W 1386 nt5.12□□□□□ -1.59
NUP49Q02199 NOP2YNL061W 1857 nt5.11□□□□□ -1.59
NUP49Q02199 YEA6YEL006W 1008 nt5.11□□□□□ -1.59
NUP49Q02199 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.1□□□□□ -1.59
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