Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHDQ02161 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHDQ02161 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHDQ02161 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHDQ02161 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHDQ02161 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHDQ02161 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHDQ02161 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHDQ02161 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHDQ02161 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHDQ02161 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHDQ02161 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHDQ02161 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHDQ02161 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHDQ02161 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHDQ02161 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHDQ02161 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHDQ02161 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHDQ02161 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHDQ02161 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHDQ02161 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHDQ02161 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHDQ02161 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RHDQ02161 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHDQ02161 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHDQ02161 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHDQ02161 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHDQ02161 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHDQ02161 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHDQ02161 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHDQ02161 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHDQ02161 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHDQ02161 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHDQ02161 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHDQ02161 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RHDQ02161 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHDQ02161 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RHDQ02161 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHDQ02161 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHDQ02161 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHDQ02161 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHDQ02161 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHDQ02161 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHDQ02161 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHDQ02161 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHDQ02161 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHDQ02161 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHDQ02161 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHDQ02161 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHDQ02161 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHDQ02161 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHDQ02161 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHDQ02161 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHDQ02161 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHDQ02161 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHDQ02161 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHDQ02161 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHDQ02161 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHDQ02161 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHDQ02161 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHDQ02161 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RHDQ02161 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHDQ02161 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHDQ02161 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHDQ02161 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RHDQ02161 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHDQ02161 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHDQ02161 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHDQ02161 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHDQ02161 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHDQ02161 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHDQ02161 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHDQ02161 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHDQ02161 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHDQ02161 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHDQ02161 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHDQ02161 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHDQ02161 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHDQ02161 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHDQ02161 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHDQ02161 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHDQ02161 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RHDQ02161 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHDQ02161 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHDQ02161 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHDQ02161 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHDQ02161 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHDQ02161 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RHDQ02161 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHDQ02161 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHDQ02161 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHDQ02161 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHDQ02161 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHDQ02161 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHDQ02161 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHDQ02161 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHDQ02161 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHDQ02161 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHDQ02161 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHDQ02161 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms