Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYBPC1Q00872 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYBPC1Q00872 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYBPC1Q00872 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms