Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKB2Q00653 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKB2Q00653 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms